面对课程改革浪潮，作为大学的附属中学，学校具有特殊优势：利用深大图书馆、实验室、体育艺术场馆等优良资源，改善了办学条件;深大教授走进课堂，帮助开齐所有选修课程，有些实验性较强的课程则安排在深大进行教学;深大教授积极对附中进行课程、教育科研课题指导和全国奥赛辅导，定期为附中师生开设"教授讲坛"和鉴赏课，举办学术热点及学科最新成果的专题讲座，拓宽了知识面，增强了融汇力;学校还以大中学生作文联赛、文娱汇演、大学生为中学生开设理想教育专题讲座等方式，促进了中学与大学的衔接。目前，学校承担有国家级课题"新基础教育发展性研究"的实验工作，还独立承担了12项省市级科研课题。