南洋模范中学的科技创新课程应创新型国家人才所需之运而生，它从科技活动脱胎而出，汲取了学用结合、能激发学生创造潜能的优点；又体现了现代课程强调学生的经验和体悟、教材、教师、学生多因素组合、课内外结合的特征，从而兼有课程知识体系集中的长处又有活动让学生体悟实践的优点，更有利于根据社情校情，开展构建学生创新能力、创造人格的教育教学活动。2006年将课程中诞生的七项发明专利应用于河道治理，荣获全国中学生水科技发明赛一等奖，并代表中国首次荣获“斯德哥尔摩青少年水奖”为国争光，同时在漕溪支河探索低成本的生态修复法——城市前置库工程系统第三种模式，已有新的进展。

2008年学校成立境外部，设有加拿大BC省海外高中课程和对外汉语课程。