2003年，三中综合高中首届毕业生参加两类高考初战告捷，取得了本科达线76人（其中普高8人，对口本科68人）的优异成绩。2004年以后的两类高考成绩直线飙升：04年本科达线125人；05年176人；06年238人；07年256人；二OO七年高考成绩一战告捷，灵璧三中本科达线率名列全省同类学校第一名，其中音体美“小三门”艺术专业录取人数近100人，被重点院校录取十多人。2008年高考再创辉煌，该校音体美专业本科达线300多人，多人在全国重点高校榜上有名。2013年高考，灵璧三中又取得了优异成绩。根据灵璧县招生委员会发布的《灵璧县2013年高考本科人数统计表》信息，我校高考报考人数805人，本科上线人数497人，上线率61.7％，全县第一，是全县同类学校本科上线人数总和的1.5倍，普通文理本科上线人数全县第一（不含两所省级示范中学）；艺体类全县上线580人，我校261人，占全县的45％，全市第一；艺体类文科全县483人，我校243人，占全县的50.3%。