六合区实验高级中学的前身为1957年创办的六合县第二中学和1983年创办的六合县第四中学。六合二中原为六城镇民办初中，文革初更名为防修中学，1975年体制上升成为县属六合县第二中学，六合二中于2001年4月被评为南京市重点中学（2004年平转为“江苏省二星级高中”）。2001年7月六合县第二中学和六合四中合并组建六合县实验中学，分高初中部两个校区。撤县并区后更名为六合区实验中学。2006年7月初中部剥离，更名为六合区实验高级中学，成为独立设置的高级中学。学校坐落在古城六合的主干道旁，校园面积105.814亩（70578平方米），建筑总面积31110 m2平方米，绿化面积25339平方米。学校教学楼宽敞明亮，实验室设施齐全，图书馆藏书丰富，运动场地堪称一流。校园环境优雅，色调和谐，精心的校园设计，创设出良好的育人环境。学校拥有普通教室4个，多媒体教室46个，理化生实验室9个，学生微机教室3个，艺术专用教室7个；拥有学生琴房、网络学习室、卫生室、心理咨询室、演播厅、校园广播系统、闭路电视系统、计算机网络系统等；学校图书馆纸质藏书达39102册，电子图书10100种，报刊杂志106种；有400米塑胶跑道的运动场，4.5片篮球场；有公寓式学生宿舍2幢，食堂1个；有教师用办公电脑180台，教学电脑240台，开通了光纤宽带上网，开设了学校网站；拥有钢琴3架、电钢琴2架、齐备的美术教育设备及数码相机、数码摄像机等各种较为先进的教辅设备。