肥西三中始建于1978年，是安徽省绿色学校、合肥市示范高中、合肥市办学水平评估优秀等级学校、肥西县体育中学、安徽省普通级体育传统项目学校，先后获合肥市德育先进单位、合肥市教育系统宣传先进单位、中央电教馆远程教育建设示范单位、合肥市文明单位、合肥市平安校园等荣誉称号。
肥西三中的办学指导思想是：坚持中国特色的社会主义办学方向，全面贯彻教育方针，全面实施素质教育；积极运用科学的教育理论和现代教育技术提高教学效率；在传授学习方法的同时逐步使学生形成合理的知识结构和能力结构，培养学生的开创意识、竞争意识、法律意识、国际意识，并形成较高的道德和理性素质；培养学生终身学习思想，释放学生个性，促进健康发展。肥西三中的办学指导思想用更为简明的语言加以概括，就是知识、能力、创新、适应。
肥西三中的发展思路是：坚持面向现代化、面向世界、面向未来，全面推进素质教育，着力打造文科品牌，文、理、艺体特色齐头并进，创造条件，有重点地渗透实用技术教育，实践多渠道培养人才之路，努力实现普高“两为”的教育教学目标。
肥西三中的办学中长期目标是：创示范高中，办安徽名校。肥西三中的学校工作方针是：稳定规模，加强管理，发展内涵，全面提高教育教学质量和办学水平。肥西三中树立了自己的绿色发展观：以学校的发展为基础，以教师的发展为前提，以学生的发展为根本。学校占地面积32亩；现有高中在校生2600人；有教职工180人，其中获高级职称的达55人。学校多次获合肥市高中教学质量综合评比及高考成果评比的一等奖、二等奖，并荣获省研究性学习课题研究集体一等奖。肥西三中现任校长：李法余（自2008年起任职）。