在2013年的高考中，巴蜀中学将有38名以上的学生考入清华大学和北京大学。在高考文科成绩中，前16名（662分）中，巴蜀占据6人，位居重庆市第一。理科600分以上的人数达294人。今年，上重点线人数理科达1103人、文科达301人，共计1404人，再创学校新高，居重庆第一。升学率达到了99.5%。